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Das Buch des Lebens lesbar gemacht.

Unter dem Titel: „Die formatierte DNA – Organisation, Struktur und Expression des menschlichen Genoms.“ hat der deutsche Bio-Informatiker Wolfgang Marks vor wenigen Tagen im Internet unter www.die-formatierte-dna.de eine universale und – wie er sagt - revolutionäre Theorie der Expression eukariotischer Gene veröffentlicht.

Wolfgang Marks - der Medizin und Chemie studiert hat, sich aber laut eigener Aussage seit mehr als 20 Jahren mit der Auswertung von großen Datenbanken und mit den Programmen beschäftigt, mit deren Hilfe das in überschaubarer Zeit möglich ist - arbeitet seit etwa der gleichen Zeit an einem mehrstufigen Computerprogramm, das auf der einen Seite bereits bekannte Verfahren der Gen- und Sequenzanalyse kombiniert (FASTA, BLAST u.a.), auf der anderen Seite aber auch von ihm selbst entwickelte Verfahren und Algorithmen in die Berechnungen einführt.

In seiner mehr als 20-jährigen intensiven Beschäftigung mit dem Aufbau und der Organisation des menschlichen Genoms glaubt Wolfgang Marks einen Weg gefunden zu haben, die großen Datenmengen des menschlichen Genoms zu analysieren, seine logische Struktur zu detektieren und – von einem gegebenen Gen ausgehend – zusammengehörige Transkriptionseinheiten (also gemeinsam regulierte und exprimierte Gene) zu identifizieren. Durch genomweites screening nach Promotoren sowohl in sense- als auch in antisense-Richtung der beiden DNA-Stränge ist dem Autor nach eigenen Angaben die Entdeckung zweier Netzwerke von bisher unbekannten Genen gelungen, die entscheidenden Einfluss auf die Genaktivierung und die Regulation der Expression von Genen haben sollen.

Das eine Netzwerk – vom Autor REMA-Gen-System genannt -  soll Proteine kodieren, die sich zu sogenannten remodeling-machines zusammenschließen, das andere – vom Autor als ALU-Gen-System bezeichnet - Transkriptionsfaktoren, die entscheidend an der Definition von Primärtranskripten und deren Spleissen zu entwicklungs- und zellspezifischen messenger-RNAs beteiligt sein sollen. 

Dieses mehrstufige Programm – von Wolfgang Marks kurz IMPACD® genannt (Integrated Mathematical ComPutational Analysis Of Arithmetic Correlations In DNA) - basiert nach Angaben des Autors auf der Hypothese, dass die Organisation des menschlichen Genoms einer mathematisch erfassbaren Ordnung unterliegt, dass also weder die Nukleotide der DNA, noch die Nukleosomen wahl- und regellos, sondern in einer Systematik angeordnet sind, die auf einer mathematisch beschreibbaren Gesetzmässigkeit basiert.

Dass es eine solche Gesetzmässigkeit, einen Code gibt, mit dessen Hilfe die Zelle die Nukleosomen auf der DNA positioniert, war schon seit einiger Zeit vermutet und von verschiedenen amerikanischen Arbeitsgruppen postuliert worden. Niemand konnte – so Wolfgang Marks -allerdings bis heute den Mechanismus entschlüsseln, der zur Aktivierung der Proteine führt, die sich – auf alle Zellen des menschlichen Organismus bezogen – zu den mehr als eintausend verschiedenen remodeling-machines zusammenschliessen, die bei jeder Zellteilung mit der permanenten Umstrukturierung – Wolfgang Marks nennt diesen Prozess „Formatierung“ -  des Genoms beschäftigt sind.

Mit Hilfe von IMPACD® hat Wolfgang Marks nach eigenen Angaben nicht nur die Struktur der DNA, ihre Einteilung in funktionelle Abschnitte und die Logik verifiziert, durch die das menschliche Hormonsystem mit Organisation und Struktur der DNA verknüpft ist, sondern an Hand des Tropomyosin alpha-Gens (TPM1) auch Schritt für Schritt den Weg beschrieben, der von diesem Gen zu einer ganz bestimmten zell- und entwicklungsspezifischen messenger-RNA eben dieses Gens führt.

Der Bio-Informatiker will in Kürze auf seiner webseite www.die-formatierte-dna.de darüberhinaus eine Ätiologie der NCL (Neuronale Ceroid Lipofuszinose) veröffentlichen: nach seinen Angaben hat er eine Reihe bisher nicht bekannter Gene, die diese vor allem bei Kindern auftretende und fast immer tödlich verlaufende Krankheit verursachen, nebst den Proteinen, die sie kodieren, identifiziert und den Krankheitsmechanismus für die am weitestens verbreitete Variante – die Juvenile NCL – entschlüsselt.

Freitag, 14. August 2009